2. Francisco de Montejo, conocido como "el Mozo", fundó la villa de San Francisco de Campeche en 1540 y mandó erigir una pequeña iglesia parroquial dedicada a la Purísima Concepción. El cronista López de Cogolludo señala que "de la iglesia parroquial de esta villa no he hallado escrito cierto del día de su fundación o dedicación. El año consta que fue de 1540 por un auto del capitán general don Francisco de Montejo, hecho en Mérida el 42 siguiente, donde dice que hizo la erección de ella con título de la Concepción de la Virgen Santa María Señora Nuestra".(1)
Cuando se incrementaron los asentamientos poblacionales y, por ende, las actividades comerciales, la villa empezó a cobrar importancia por lo que se construyó un templo más amplio. Se desconoce cuándo se inició la construcción, pero gracias a las donaciones de Margarita Guerra, vecina del lugar, se concluyó en su totalidad. En 1758 se llevaron a cabo obras de ampliación y se levantó la torre conocida como "La española", en donde se colocaron las campanas que anteriormente pendían de la espadaña, ya demolida, así como el primer reloj público que tuvo la ciudad. En el centro del frontispicio se labró un escudo español, el cual se destruyó después de la Independencia, y en 1866 se puso la carátula del reloj municipal, el cual fue retirado seis años después.
De acuerdo con la costumbre de la época, y por considerarlo un sitio sagrado, en el interior del templo había cuatro criptas, a los pies del altar, en donde se sepultaron los restos humanos de personas importantes de la comunidad, como militares, eclesiásticos, hermanos de la Archicofradía del Santísimo Sacramento, y un espacio más reservado a doña Margarita Guerra, personaje de renombre en Campeche. Asimismo, los tramos de la nave se reservaban para las personas de menor rango social o económico. Esta costumbre persistió hasta que se cambió el piso de ladrillo por mármol.
La parroquia fue consagrada en 1835 por José María Guerra, obispo de Yucatán, y a finales del siglo XVIII y principios del XIX, se colocaron varias campanas, solicitadas por el obispo Antonio Caballero y Góngora, quien bendijo la mayor y estrenó la pila bautismal --que aún se encuentra en la catedral-- donada por el cura Cayetano Pérez Abreu.
En 1850 se levantó la torre conocida como "La campechana", y 66 años después se instaló un reloj con cuatro carátulas, que aún se conserva. En 1851, el presbítero Prefecto Regil obsequió la reja de hierro del presbiterio; en 1884 se enladrilló el atrio, con material de origen belga; y en 1896 se colocó la reja de hierro que actualmente circunda al inmueble.
A través de la Bula Praedecessorum Nostrarum, del 24 de marzo de 1896, el papa León XIII fundó la nueva Diócesis de Campeche; mandato que fue ejecutado por el obispo de Yucatán, Crescencio Carrillo y Ancona, con lo que se elevó a catedral la antigua parroquia.
Hacia el lado izquierdo del monumento se encuentra la capilla de Jesús Nazareno, cuyo patio se utilizaba como cementerio. En ella se daban servicios religiosos de difuntos. A un costado de la catedral se encontraba el obispado, en lo que era la antigua parroquia, por lo que fue necesario renovar los techos y tirar varios muros; también se construyó un aljibe y se instaló un molino de viento. Los trabajos de reparación y adaptación se terminaron en abril de 1907. (1)
Incluido en la declaratoria de zona de monumentos históricos de la ciudad de Campeche, publicada en el Diario Oficial de la Federación el 10 de diciembre de 1986.

(1) Aída Amine Casanova Rosado, Campeche intramuros, Campeche, Colección Raíces Campechanas, 1995, p. 27.