Las garitas surgieron ante la necesidad de control comercial y aduanal sobre todo de aquellos productos que entraban o salían de la Ciudad de México, durante los años de 1632-1647, función que conservaron hasta 1896 en que fueron suprimidas.

La garita de San Lázaro, cercana a las Atarazanas de Cortés en el embarcadero adonde llegaban todos los granos y semillas de las haciendas situadas en los márgenes del Lago de Texcoco, era el enlace con el camino que comunicaba a la Ciudad de México con el Puerto de Veracruz y por donde llegaban los productos de tierra caliente. Además de sus funciones específicas, el edificio tenía dos viviendas para los guardias con sus respectivas familias, en 1801 se le edificó otra y en 1820 se le hicieron ampliaciones.

En 1896 fue acondicionada para funcionar como escuela primaria, pero en 1913 se instaló ahí la intendencia de la Dirección General de Telégrafos donde laboraba el personal de mantenimiento y un departamento de operación de líneas telegráficas, por lo que se erigió una torre metálica que sobresalía.

En 1965 el inmueble fue utilizado para bodegas y viviendas. En 1982 por decreto presidencial fue puesto bajo la custodia de la entonces SAHOP y en 1982-1983 fue acondicionado para funcionar como guardería dependiente del Palacio Legislativo.

Fue declarada monumento el 9 de febrero de 1931.