"Es una capilla franciscana del siglo XVI que conserva la distribución espacial de sus dos recintos contiguos nave y presbiterio. Muestra todavía la portada original, con fecha de 1564, y un alfiz algo vertical que surge de las impostas del arco de medio punto que cierra la puerta. Dichas impostas presentan hileras de chalchihuites, circunferencias concéntricas que en el mundo mesoamericano simbolizan objeto precioso en un sentido profundo. Las basas de las jambas tienen los mismos relieves que las impostas o capiteles, aunque con el dibujo y secciones invertidos, a manera del reflejo en un espejo, disposición típica del siglo XVI.
Es notable el interior de la capilla con su direccionalidad desde la puerta hacia el altar, ubicado en el espacio del presbiterio un poco más alto al piso de la nave. Las sucesivas ampliaciones del siglo XX para aumentar la capacidad del público no llegan a anular el sentido espacial original, el cual produce en el espectador una vivencia muy agradable.
En el atrio, amplio todavía, tiene olivos muy viejos y una cruz de piedra de relieves primorosos con una corona de espinas en el crucero, también característica de la época. El atrio era más grande; lo recortaron al hacer el nuevo trazo de la calle, por lo cual la cruz queda a un costado del patio". (Asociación del Patrimonio Artístico Mexicano, A. C. 2004: 113).

"Al hacer las excavaciones para los cimientos de su templo; los franciscanos encontraron un ídolo de piedra de cantera, el cual según don Ángel María Garibay, fue transformado en cruz atrial que hoy podemos admirar.
Esta cruz fue rematada en sus extremos con flores y los escudos franciscanos con sus cinco llagas se observan en la base. Un cráneo y dos canillas-típico símbolo de la orden de San Francisco- se aprecian en la cara de la cruz que da al acceso del templo cuya construcción se terminó el 29 de septiembre de 1563, de acuerdo con la inscripción que muestra su fachada". (Gobierno del Distrito Federal, Delegación Benito Juárez 2002:26).

Fundación Franciscana más antigua de la Delegación, Benito Juárez, data del año 1564, mientras que la torre es del siglo XVII.

Fue declarado monumento histórico el 2 de noviembre de 1932.

El ciprés de estilo neoclásico que se encontraba en el altar fue retirado en el año de 2009, se desconoce la fecha de su construcción.

“La pila de agua bendita seguramente es prehispánica con ricos relieves ajenos al arte cristiano. Dos esculturas estofadas del Siglo XVII con tamaño aproximado de 1m. la 1 representa San Elías y otra una virgen. Un cristo de tallos y hojas de maíz en tamaño natural, pintado de negro por ser la advocación de “Esquipulas” probablemente del Siglo XVI en el que los tarascos eran hábiles artistas de estas esculturas. Un lienzo de la Virgen de Guadalupe tamaño aproximado de 0.80 x 1.20 de principios del Siglo XVII de artista desconocido, teniendo mucha importancia las pinturas de sus esquinas. Un lienzo de San José autor anónimo. Tamaño aproximado de 0.80 x 1.20 del Siglo XVII muy interesante.”
“En el frontón existe esta inscripción: “A XXIX días del mes de Sedibl: MDLXIIIL”. (1587). En una reciente excavación que se practicó bajo el muro del lado sur de la iglesia se encontró la parte superior de una estela que dice: Gobernando esta Nueva España el Ilmo. y Exmo. Señor Dr. Dn. Juan Antonio de Vizarrón Arzobispo y en virtud de su Ministerio, Don Pedro Malo de Villavicencio Caballero de Calatrava Oidor”. Como es del Siglo XVIII se refiere probablemente a composturas que se hayan hecho al templo.” De un documento sin fecha, aproximadamente 1932 (Enciso 1932: s/f).